128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0507 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  100 
 
 		 483 aa  999    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 		 485 aa  519  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  50.31 
 
 		 499 aa  500  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  43.96 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  42.82 
 
 		 498 aa  346  6e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  52.96 
 
 		 314 aa  317  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  50.16 
 
 		 322 aa  310  5e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 622 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.37 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1442  putative transcriptional regulator  42.28 
 
 		 179 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 504 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 606 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 		 643 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1151  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 163 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.796033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 663 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 402 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 656 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 656 aa  93.6  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25.62 
 
 		 479 aa  87  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 		 620 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 		 620 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 386 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.16 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  30.1 
 
 		 205 aa  79.7  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0363  divergent AAA ATPase  52.56 
 
 		 95 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23.29 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  22.02 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  25.72 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  25.64 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  22.3 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  27.4 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.42 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  22.11 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.55 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  29.29 
 
 		 198 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  21.1 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  22.25 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  23.63 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.08 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 687 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 		 391 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  33.61 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 628 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.27 
 
 		 175 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  22.73 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  21.18 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  22.98 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  19.8 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.33 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  32.03 
 
 		 209 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  21.36 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  38.18 
 
 		 122 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.35 
 
 		 336 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  23.87 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 208 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.14 
 
 		 478 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  30.56 
 
 		 207 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  22.25 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  22.64 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  37.18 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  35.71 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  21.4 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2244  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 82 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  25.08 
 
 		 492 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 206 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>