137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2526 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  84.51 
 
 
382 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  100 
 
 
391 aa  793    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  54.11 
 
 
454 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
385 aa  293  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  39.45 
 
 
299 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 
386 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 
396 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  30.75 
 
 
403 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  30.75 
 
 
403 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 
471 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 
480 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 
413 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 
480 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 
376 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 
494 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 
455 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 
469 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 
422 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  29.76 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 
423 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 
423 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 
485 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 
620 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 
448 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 
456 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 
477 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25 
 
 
430 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
522 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  33.33 
 
 
526 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 
433 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 
468 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 
455 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.35 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  23.14 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 
463 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 
448 aa  87.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 
572 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
508 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 
467 aa  86.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 
502 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.77 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.73 
 
 
479 aa  77  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.08 
 
 
311 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.73 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  30.77 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.47 
 
 
538 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 
492 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  22.63 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 
582 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.8 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.05 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.08 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.35 
 
 
687 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25 
 
 
469 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 
582 aa  66.6  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 
235 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.7 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  22.53 
 
 
1123 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 
208 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 
498 aa  63.9  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 
358 aa  63.2  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  26.58 
 
 
1492 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1275  putative transcriptional regulator  58 
 
 
124 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  28.97 
 
 
276 aa  60.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 
226 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  57.45 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.81 
 
 
571 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  57.45 
 
 
204 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  20.35 
 
 
499 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 
545 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  21.24 
 
 
458 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  29.05 
 
 
429 aa  57  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 
241 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>