150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0182 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 478 aa  974    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  51.63 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  53.7 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  38.15 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  37.94 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  34.77 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 480 aa  156  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 481 aa  149  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  41.59 
 
 		 198 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.68 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 502 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 469 aa  123  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.29 
 
 		 526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 334 aa  120  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 620 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 235 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 500 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  28.73 
 
 		 548 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.92 
 
 		 385 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  32.69 
 
 		 205 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  26.75 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 545 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  23.33 
 
 		 479 aa  89.7  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  23.5 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 412 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 469 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  29.11 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  21.41 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.29 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 519 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  28.04 
 
 		 555 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 538 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  26.79 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25.89 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 336 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  48.72 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.05 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.07 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 687 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.13 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.4 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  47.44 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.86 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.37 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  25.53 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 		 571 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  23.22 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.25 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  21.81 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>