More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3863 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 334 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  84.08 
 
 		 336 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  59.75 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  54.33 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  53.85 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  47.96 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  59.58 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  55.47 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.67 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.83 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  53.39 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.79 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  65.67 
 
 		 224 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.7 
 
 		 175 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  72.5 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.84 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.21 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  56.96 
 
 		 481 aa  92.8  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  44.55 
 
 		 198 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.09 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.41 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  32.37 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.8 
 
 		 248 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.51 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.51 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  29.46 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.09 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  29.62 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  54.29 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  26.03 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  48.1 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.99 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.11 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  26.03 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  27.75 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.41 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  30.8 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.39 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  25 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.88 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  31.96 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.71 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.54 
 
 		 394 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.26 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  39.05 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.35 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  29.05 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  32.72 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.43 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.52 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  29.49 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.15 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.27 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.7 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  36.13 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.52 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.46 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.3 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.04 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.37 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.67 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  43.68 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  25 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.53 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.45 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.14 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.05 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.11 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  35.66 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  32.53 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.17 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.3 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.54 
 
 		 412 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.68 
 
 		 389 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.22 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.99 
 
 		 384 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.83 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.24 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.73 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.62 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.69 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.88 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.45 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.62 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  38.55 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.05 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.31 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0444  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.98 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.401408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.77 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>