49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1812 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.22 
 
 
336 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  65.67 
 
 
334 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  60.77 
 
 
175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  62.9 
 
 
330 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  63.53 
 
 
342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  55.17 
 
 
331 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  43.93 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  49.43 
 
 
328 aa  96.3  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  55.81 
 
 
328 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 
481 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  53.01 
 
 
477 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  53.25 
 
 
508 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.57 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.57 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  48.24 
 
 
352 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  46.05 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.05 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  60 
 
 
502 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  46.25 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  48.57 
 
 
478 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  47.06 
 
 
322 aa  64.3  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 
480 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  47.69 
 
 
484 aa  62.8  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
471 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  47.3 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  47.3 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  44.62 
 
 
122 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  37.31 
 
 
479 aa  53.9  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  39.68 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 
499 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2244  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 
82 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0363  divergent AAA ATPase  38.37 
 
 
95 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  40 
 
 
485 aa  49.7  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  44.07 
 
 
526 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 
522 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 
620 aa  48.9  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
475 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 
519 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1148  hypothetical protein  44.07 
 
 
113 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 
462 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0436  hypothetical protein  68.97 
 
 
89 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1151  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.796033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.74 
 
 
367 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  47.62 
 
 
483 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
509 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>