142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1900 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  41.09 
 
 
620 aa  177  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 
471 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 
502 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
226 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
469 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 
478 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  31 
 
 
480 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 
480 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  28.71 
 
 
479 aa  92  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  48.08 
 
 
122 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 
481 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  30.32 
 
 
508 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 
462 aa  88.6  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  28 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 
475 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 
494 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 
477 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 
519 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  84  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  33.82 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 
433 aa  82  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.39 
 
 
526 aa  82.4  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  36.08 
 
 
311 aa  82  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  32.92 
 
 
467 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 
485 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 
448 aa  72.8  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
455 aa  72.4  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  32.39 
 
 
462 aa  72  0.000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 
456 aa  71.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  33.08 
 
 
687 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  40.7 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 
561 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  27.54 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.41 
 
 
484 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  34.23 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 
448 aa  68.6  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2244  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
82 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  30 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 
572 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  37.89 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  33.05 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  33.05 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  32.9 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  26.09 
 
 
483 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 
468 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 
571 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 
606 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 
479 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 
459 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
358 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 
412 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 
472 aa  63.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
386 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
455 aa  63.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 
463 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 
412 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 
376 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 
469 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 
509 aa  62  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 
582 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  42.68 
 
 
396 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
456 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 
402 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
402 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 
499 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 
641 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 
413 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
412 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  38.54 
 
 
475 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  33.63 
 
 
299 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  33.06 
 
 
456 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  33.33 
 
 
634 aa  58.9  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  33.63 
 
 
385 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
488 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
500 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 
581 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
446 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  32.97 
 
 
453 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  30.29 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 
485 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  30.29 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 
586 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 
478 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  46.55 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  60.98 
 
 
334 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
334 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  33.68 
 
 
548 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 
545 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 
582 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 
483 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
430 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 
556 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>