101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0641 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  63.29 
 
 		 488 aa  283  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  53.14 
 
 		 483 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  53.14 
 
 		 470 aa  227  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 		 472 aa  221  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 483 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  50.95 
 
 		 483 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 478 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  47.34 
 
 		 484 aa  204  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4293  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2492  putative transcriptional regulator  54.76 
 
 		 92 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  59.02 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 480 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  33.83 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 468 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 471 aa  61.6  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  32.14 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  34.4 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  31.93 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  37.86 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 571 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 509 aa  58.2  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  32.98 
 
 		 462 aa  58.2  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  30.53 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  38.89 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  38.89 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 453 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 556 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 606 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 663 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 467 aa  55.1  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 634 aa  55.1  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 		 589 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 427 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 619 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 469 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 581 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 582 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 545 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 687 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  27.08 
 
 		 475 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 641 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  30.51 
 
 		 456 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 473 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 413 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1492 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 620 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 620 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 455 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 469 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  31.43 
 
 		 442 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 561 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 475 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 462 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.13 
 
 		 456 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 448 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  23.75 
 
 		 472 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 334 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  31.07 
 
 		 548 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 448 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 572 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 448 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 478 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 611 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 433 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 402 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 568 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 423 aa  45.1  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 551 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 483 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 		 481 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 582 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  51.16 
 
 		 492 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 		 463 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 500 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 545 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 423 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 508 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 386 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 522 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.73 
 
 		 526 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 628 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 441 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  29.38 
 
 		 478 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 396 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 586 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>