149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0182 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  100 
 
 
606 aa  1249    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  43.95 
 
 
634 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  46.54 
 
 
687 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  40.69 
 
 
611 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 
641 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 
628 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 
582 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 
622 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 
571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.6 
 
 
572 aa  143  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 
620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 
620 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25.93 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 
620 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  28 
 
 
433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  22.83 
 
 
643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 
656 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  23.38 
 
 
656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 
448 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  21.94 
 
 
663 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
492 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  24.28 
 
 
543 aa  104  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 
448 aa  101  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 
456 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 
504 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  25 
 
 
515 aa  100  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
602 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 
386 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
582 aa  94  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.76 
 
 
480 aa  93.6  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  24.16 
 
 
483 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 
430 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23 
 
 
469 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  28.05 
 
 
483 aa  89.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 
468 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 
480 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 
396 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  23.78 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 
394 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 
561 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 
545 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 
508 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 
663 aa  84.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.83 
 
 
484 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
412 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  29.66 
 
 
526 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 
522 aa  82.4  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.86 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.48 
 
 
548 aa  79.7  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
494 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
538 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23.97 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  26.07 
 
 
478 aa  77  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  29.48 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 
545 aa  72.8  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  27.51 
 
 
276 aa  72  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
560 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.72 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 
412 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  21.26 
 
 
459 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  26.29 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 
581 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  29.67 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 
456 aa  67  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 
422 aa  67  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  22.51 
 
 
374 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 
389 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 
459 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 
488 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  20.7 
 
 
462 aa  64.7  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 
235 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  20.55 
 
 
460 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 
413 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>