141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3153 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  73.02 
 
 		 628 aa  879    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 611 aa  1240    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  47.01 
 
 		 634 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 641 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 687 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  41.01 
 
 		 606 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  42.15 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 582 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25.87 
 
 		 622 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 571 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  26.16 
 
 		 475 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 656 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 656 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  24.13 
 
 		 643 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 515 aa  104  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  27.67 
 
 		 548 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 		 663 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 468 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  29.4 
 
 		 448 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 456 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  22.74 
 
 		 469 aa  95.1  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.02 
 
 		 448 aa  94.7  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  23.27 
 
 		 543 aa  92.8  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 620 aa  90.9  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 396 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  32.4 
 
 		 459 aa  87  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 504 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 545 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 582 aa  85.5  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 509 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  26.07 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 663 aa  77.8  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  32.01 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  28.3 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  24.22 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3526  putative transcriptional regulator  23.36 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  25.43 
 
 		 555 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 572 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  27.06 
 
 		 478 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  29.84 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  23.52 
 
 		 485 aa  67  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 376 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.48 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  27.16 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23.12 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  23.6 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.57 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.53 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  25.26 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 581 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  20.52 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  22.53 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 519 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.73 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 427 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>