126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0636 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 492 aa  1007    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 582 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 571 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  30.74 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  32.01 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 602 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 687 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 634 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  30.03 
 
 		 396 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.73 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 422 aa  94.4  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 561 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  28.54 
 
 		 423 aa  94  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 385 aa  93.2  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.41 
 
 		 469 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  28.32 
 
 		 475 aa  87.8  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  20.95 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  27.79 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.69 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  23.7 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 611 aa  77.4  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  22.17 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  22.9 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.77 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 620 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  22.13 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  22.45 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  25.09 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  25.09 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  20.4 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  23.48 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  28.94 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 299 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.11 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  24.2 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  23.54 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.33 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 622 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.58 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  35 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  22.53 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  49.02 
 
 		 205 aa  57  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  22.54 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  22.54 
 
 		 656 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 		 663 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 		 499 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  26.08 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  21.9 
 
 		 581 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  22.58 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  32.33 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  22.91 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>