123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0062 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  100 
 
 
453 aa  921    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  30.27 
 
 
433 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  34.96 
 
 
311 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 
469 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.1 
 
 
462 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.21 
 
 
442 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 
459 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 
433 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  28.03 
 
 
276 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 
456 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.37 
 
 
480 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 
477 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 
226 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.24 
 
 
494 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 
448 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 
456 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 
484 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  22.29 
 
 
467 aa  87.4  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  22.22 
 
 
479 aa  85.9  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 
481 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.1 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  46.25 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  22.27 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25 
 
 
620 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  43.88 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  41.25 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  20.77 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  35.54 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  35.54 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
485 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.04 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.22 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 
582 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  23.45 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  24.3 
 
 
522 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 
572 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  24.5 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 
551 aa  67  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 
483 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.83 
 
 
526 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 
545 aa  66.6  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  30.88 
 
 
687 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 
469 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  22.58 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 
509 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 
396 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 
582 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 
663 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 
581 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 
473 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  28.57 
 
 
198 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.33 
 
 
423 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  36.89 
 
 
564 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  26.32 
 
 
634 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  22.02 
 
 
606 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 
334 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  21.83 
 
 
376 aa  60.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 
589 aa  60.1  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 
402 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 
519 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 
641 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  30 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  21.96 
 
 
586 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  25.1 
 
 
543 aa  57.8  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
207 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 
235 aa  57  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  30.95 
 
 
205 aa  56.6  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 
402 aa  56.6  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 
462 aa  56.6  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.88 
 
 
556 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  22.46 
 
 
571 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  29.82 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  26.73 
 
 
555 aa  53.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  34.19 
 
 
561 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>