137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0250 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 383 aa  793    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  56.45 
 
 		 478 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  35.49 
 
 		 433 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  36.77 
 
 		 448 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.75 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  30.82 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  24.53 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.91 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  28.62 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 479 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27 
 
 		 471 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 454 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 480 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 		 456 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  25.57 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23.85 
 
 		 462 aa  82.8  0.000000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  27.27 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.18 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 545 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  23.01 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.37 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 687 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  26.75 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 634 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.84 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 1123 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 620 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  37.4 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  23.45 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2123  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  30.06 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  32.9 
 
 		 235 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  39.09 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.54 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  23.65 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.63 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  22.55 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.18 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  22.74 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.91 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  26.04 
 
 		 555 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  23.59 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  21.12 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  30.86 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  21.59 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 641 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.54 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.32 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>