135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0100 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  100 
 
 
311 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  34.96 
 
 
453 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 
433 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  36.51 
 
 
462 aa  144  2e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  33.2 
 
 
276 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 
467 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
485 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  30.77 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 
457 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 
454 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 
469 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.04 
 
 
433 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 
494 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
448 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 
459 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 
446 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 
448 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
358 aa  99.8  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
479 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 
480 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 
480 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 
468 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 
383 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 
462 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  28.96 
 
 
582 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 
469 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  30 
 
 
456 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  24.66 
 
 
462 aa  88.2  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
467 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 
475 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  32.72 
 
 
471 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  28.22 
 
 
479 aa  83.2  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  30.82 
 
 
620 aa  83.2  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  29.32 
 
 
475 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  31.76 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.37 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  41.25 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 
483 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 
386 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  40.86 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 
571 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 
477 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  28.11 
 
 
555 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 
572 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 
456 aa  69.3  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  23.6 
 
 
556 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 
473 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.99 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.82 
 
 
456 aa  66.2  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  27.11 
 
 
526 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 
522 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
412 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  30 
 
 
582 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 
545 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  25 
 
 
515 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  24 
 
 
548 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 
504 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 
412 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 
413 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  31.75 
 
 
205 aa  64.3  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  31.37 
 
 
198 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  32.62 
 
 
1492 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 
551 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 
422 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 
545 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 
423 aa  62.4  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 
484 aa  62.4  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 
462 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
663 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  26.59 
 
 
423 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
472 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.47 
 
 
687 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0136  transcription regulator  28.75 
 
 
170 aa  59.3  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0628959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 
581 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  24.91 
 
 
1123 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 
589 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  41.51 
 
 
448 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 
472 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  34.44 
 
 
470 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 
509 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>