52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0136 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0136  transcription regulator  100 
 
 		 170 aa  350  5e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0628959  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  32.3 
 
 		 456 aa  87  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 468 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 479 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 456 aa  67.4  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  40.23 
 
 		 561 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 469 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 473 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 582 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 472 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 462 aa  57.8  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 448 aa  57.4  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 433 aa  54.3  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 		 500 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  26.99 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 508 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 456 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 620 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.71 
 
 		 526 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 522 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 545 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 545 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 412 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 386 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 448 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 		 396 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 471 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  35.9 
 
 		 382 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 480 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 571 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 448 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  25.3 
 
 		 555 aa  45.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 538 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 480 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 422 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 453 aa  44.7  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 455 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 494 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 502 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 391 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 402 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 478 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 472 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  28.35 
 
 		 470 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 394 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 467 aa  41.6  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 469 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 423 aa  40.8  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>