153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2738 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 561 aa  1155    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  27.58 
 
 		 479 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 455 aa  123  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  30.77 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 582 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 430 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 571 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 456 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 455 aa  107  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 545 aa  107  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.06 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.16 
 
 		 555 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  27.12 
 
 		 548 aa  100  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  25.43 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 		 620 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 462 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 		 483 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 386 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 448 aa  94.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 492 aa  94.4  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 376 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  29 
 
 		 423 aa  90.9  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 687 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 472 aa  87.4  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 412 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  21.94 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 606 aa  85.9  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.09 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  27.58 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  24.8 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  24.23 
 
 		 663 aa  80.5  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 		 494 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  22.15 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.33 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  28.63 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.57 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  30.8 
 
 		 522 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 226 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.8 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.97 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  26.2 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0136  transcription regulator  40.23 
 
 		 170 aa  67  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0628959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  26.02 
 
 		 454 aa  67  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  34.78 
 
 		 205 aa  66.6  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  24.74 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>