104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3430 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 483 aa  1001    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  44.21 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  43.82 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  39.84 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  38.72 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  39.54 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  36.42 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  38.92 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 207 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4293  hypothetical protein  45.58 
 
 		 153 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 568 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1286  putative transcriptional regulator  29.5 
 
 		 219 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 572 aa  100  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  23.4 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2492  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 92 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  22.14 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 560 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 634 aa  63.9  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  22.77 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  24.01 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  22.76 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  22.05 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  22.84 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  31.69 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  30.4 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  20.87 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  23.23 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  22.7 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1492 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  22.74 
 
 		 538 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 620 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  23.02 
 
 		 628 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  23.13 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  30.77 
 
 		 548 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 235 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.62 
 
 		 462 aa  55.1  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 545 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  32.67 
 
 		 276 aa  54.7  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  35.29 
 
 		 552 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 427 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  21.63 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  30.48 
 
 		 555 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.54 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 		 589 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 564 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 556 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  30.84 
 
 		 582 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 619 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  29.82 
 
 		 582 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 389 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 687 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 545 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  22.7 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2084  divergent AAA region  30.89 
 
 		 135 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.497784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  21.99 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  26.77 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  20.59 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  22 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 433 aa  47  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  31.11 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  22.37 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  23.05 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  21.88 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 522 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>