90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  100 
 
 		 582 aa  1159    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  47.86 
 
 		 589 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  33.79 
 
 		 599 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  31.41 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 564 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.67 
 
 		 555 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 582 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  24.13 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23.08 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.96 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  23.55 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 468 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 427 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 448 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  23.05 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  27.02 
 
 		 606 aa  63.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 687 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  24.92 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  21.33 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  31.93 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  22.15 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.07 
 
 		 481 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  22.54 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  20.75 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 634 aa  57  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  23.42 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 488 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 		 358 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 560 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  22.99 
 
 		 483 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.44 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 		 561 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 641 aa  55.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.7 
 
 		 382 aa  54.7  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.69 
 
 		 403 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 403 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 311 aa  52.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  23.14 
 
 		 386 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 620 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  20.53 
 
 		 480 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  20.74 
 
 		 469 aa  50.4  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  21.8 
 
 		 394 aa  50.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.29 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 572 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 663 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  21.87 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  21.83 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  23.33 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1492 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  21.43 
 
 		 226 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  23.32 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 545 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.29 
 
 		 484 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  47.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  35.79 
 
 		 479 aa  47.4  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  36.05 
 
 		 205 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  24.23 
 
 		 462 aa  47  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  30.24 
 
 		 611 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 571 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  23.62 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 628 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 522 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4293  hypothetical protein  29.52 
 
 		 153 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  29.66 
 
 		 526 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 515 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  22.02 
 
 		 499 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 500 aa  44.3  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>