136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0615 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  70.97 
 
 
470 aa  703    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  100 
 
 
472 aa  975    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  51.23 
 
 
488 aa  331  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  40.04 
 
 
483 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  38.44 
 
 
483 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 
478 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  34.85 
 
 
484 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 
483 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  52.17 
 
 
207 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  37.47 
 
 
538 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  37.8 
 
 
376 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4293  hypothetical protein  46.26 
 
 
153 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 
494 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.86 
 
 
455 aa  104  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 
480 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 
471 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 
485 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
554 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  28.46 
 
 
456 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 
468 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 
560 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 
479 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 
561 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 
448 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2492  putative transcriptional regulator  44.71 
 
 
92 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  24 
 
 
556 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 
448 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  23.33 
 
 
552 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 
581 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.61 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  35.09 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  29.03 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 
571 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 
620 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 
481 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  23.99 
 
 
545 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 
582 aa  67.8  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  28.06 
 
 
442 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.43 
 
 
403 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 
545 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  22.69 
 
 
483 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.43 
 
 
403 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
383 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 
586 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 
235 aa  63.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 
467 aa  63.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23.88 
 
 
469 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 
427 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 
500 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  31.5 
 
 
687 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  29.5 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  22.43 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 
472 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  23.77 
 
 
477 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 
469 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  21.01 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
463 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.32 
 
 
548 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  22.08 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
358 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 
475 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 
462 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  33.66 
 
 
526 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 
663 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 
572 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 
509 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  33.66 
 
 
522 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 
564 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 
508 aa  57  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  26.23 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 
502 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  28.05 
 
 
1492 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  22.76 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  23.87 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 
656 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.4 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 
226 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  22.9 
 
 
572 aa  53.5  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 
663 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>