93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5813 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  100 
 
 
564 aa  1140    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  40.07 
 
 
586 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 
599 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  31.27 
 
 
589 aa  155  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  27.78 
 
 
555 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.5 
 
 
582 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 
545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  24.42 
 
 
556 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  24.82 
 
 
548 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  26.37 
 
 
581 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 
538 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.48 
 
 
551 aa  96.3  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 
456 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 
556 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  21.65 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 
560 aa  72.8  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  22.29 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 
430 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 
481 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.59 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 
334 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 
226 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 
468 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26 
 
 
620 aa  63.9  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
463 aa  63.9  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 
412 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 
477 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 
459 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  36.89 
 
 
453 aa  62.4  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 
433 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.18 
 
 
446 aa  61.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 
571 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 
480 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.25 
 
 
475 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 
456 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  24.73 
 
 
552 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 
457 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 
472 aa  57.4  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  30.03 
 
 
478 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 
494 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  21.35 
 
 
471 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 
358 aa  51.6  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.19 
 
 
403 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 
403 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25 
 
 
479 aa  51.2  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
545 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  22.45 
 
 
554 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 
441 aa  50.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 
515 aa  50.4  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  34.74 
 
 
634 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  21.19 
 
 
402 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 
394 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  32.03 
 
 
488 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  28.24 
 
 
276 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  33.05 
 
 
235 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  27.55 
 
 
311 aa  48.9  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 
427 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  22.49 
 
 
470 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  26.52 
 
 
483 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.95 
 
 
382 aa  47.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 
568 aa  47.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
561 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 
641 aa  47.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
412 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 
619 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 
606 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.6 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 
402 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  22.69 
 
 
582 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 
622 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  31.25 
 
 
687 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 
663 aa  44.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 
663 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  30 
 
 
483 aa  43.9  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 
394 aa  43.9  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  32.43 
 
 
572 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 
508 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>