171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0539 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  100 
 
 
430 aa  869    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 
448 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 
485 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 
433 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 
494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 
480 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
480 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25 
 
 
386 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 
467 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 
561 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.43 
 
 
481 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 
456 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 
396 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 
468 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 
469 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  26.93 
 
 
385 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 
463 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 
459 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 
433 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 
479 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 
446 aa  104  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 
467 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 
484 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 
571 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 
477 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  30.28 
 
 
479 aa  96.3  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 
469 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  27.86 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 
500 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 
582 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 
334 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 
457 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.95 
 
 
403 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 
403 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 
581 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 
606 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
412 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 
472 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  22.98 
 
 
456 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 
556 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  24.44 
 
 
545 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 
413 aa  87.4  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  24.31 
 
 
548 aa  87  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 
394 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  25.15 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  24.79 
 
 
555 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.52 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.44 
 
 
526 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.17 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
502 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 
508 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  24.66 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.18 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  23.9 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 
619 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.63 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 
572 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27.95 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  22.85 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.3 
 
 
620 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 
611 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  23.42 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  29.96 
 
 
276 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.86 
 
 
687 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  34.62 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 
582 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.78 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 
564 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  22.34 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 
138 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 
475 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 
641 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  22.1 
 
 
586 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  23.48 
 
 
462 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>