130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1129 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 475 aa  984    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  83.69 
 
 		 462 aa  800    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  50.27 
 
 		 442 aa  358  8e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 480 aa  123  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  27.43 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  25.74 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 480 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.39 
 
 		 620 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 508 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 		 235 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 403 aa  96.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  25.66 
 
 		 403 aa  96.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  29.14 
 
 		 314 aa  95.9  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.55 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  28.53 
 
 		 322 aa  89.7  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 502 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 663 aa  80.5  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.11 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  29.44 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.42 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  29.09 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.45 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  25 
 
 		 526 aa  70.1  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  30.97 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 467 aa  67  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  23.62 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.68 
 
 		 175 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0363  divergent AAA ATPase  48.19 
 
 		 95 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.41 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2380  hypothetical protein  32.9 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  23.2 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2011  putative transcriptional regulator  32.9 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  23.39 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  36.7 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 606 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  24.21 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  22.34 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  23.17 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  28.77 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  26.52 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 376 aa  57  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 634 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.14 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  32.65 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1492 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 572 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  22.38 
 
 		 545 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  24.34 
 
 		 548 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.08 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  41.03 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 663 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  32.43 
 
 		 331 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  20.7 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 571 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.72 
 
 		 336 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>