151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0042 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  100 
 
 
462 aa  943    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  41.81 
 
 
467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  40.77 
 
 
479 aa  293  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  43.7 
 
 
276 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  36.51 
 
 
311 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.77 
 
 
433 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 
469 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  40.37 
 
 
205 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 
471 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.58 
 
 
433 aa  123  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 
469 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  23.32 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 
485 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 
494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 
455 aa  113  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 
448 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  26.89 
 
 
462 aa  108  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 
454 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  23.56 
 
 
448 aa  107  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  28.6 
 
 
457 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.22 
 
 
455 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.78 
 
 
446 aa  99.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 
620 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  22.6 
 
 
456 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25 
 
 
484 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 
459 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 
456 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 
582 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 
572 aa  90.5  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  21.96 
 
 
468 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.44 
 
 
442 aa  89.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 
561 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.72 
 
 
581 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 
396 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 
386 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 
412 aa  86.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  21.63 
 
 
515 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  23.81 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.8 
 
 
606 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
556 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  41.67 
 
 
555 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  20.34 
 
 
545 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 
502 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25.29 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  24.28 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.57 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 
571 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  20.73 
 
 
548 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 
582 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  21.88 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  22.68 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
226 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  34.78 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.44 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 
538 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  22.36 
 
 
611 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  25.4 
 
 
526 aa  67  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  21.59 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  27.66 
 
 
483 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  21.55 
 
 
599 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 
462 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  23.98 
 
 
634 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
483 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.87 
 
 
687 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 
473 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 
586 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 
589 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 
508 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  21.29 
 
 
545 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
427 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 
478 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  28.4 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  27.03 
 
 
1492 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>