113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4679 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  84.11 
 
 		 484 aa  853    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 478 aa  983    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  43.82 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  42.8 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  37.95 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  35.59 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  37.2 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 207 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 568 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4293  hypothetical protein  43.92 
 
 		 153 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1286  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 		 572 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2492  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 92 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 538 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  23.73 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.41 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 687 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  23.34 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  31.63 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 620 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  23.13 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  34.15 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  36.8 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  22.74 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  34.17 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  28.96 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.62 
 
 		 376 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 235 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  23 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  23.51 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  23.23 
 
 		 552 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 606 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  22.79 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  22.59 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 571 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 545 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 561 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  22.67 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 554 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 641 aa  53.5  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 620 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 620 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.78 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  23.02 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 572 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 634 aa  50.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 551 aa  50.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  23.65 
 
 		 394 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  20.67 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  30 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 226 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  22.17 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  22.44 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  32.11 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3392  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  23.01 
 
 		 602 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2084  divergent AAA region  32.22 
 
 		 135 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.497784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  26.13 
 
 		 276 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>