150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3533 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  100 
 
 
459 aa  929    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  63.58 
 
 
468 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  61.64 
 
 
479 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  60.76 
 
 
456 aa  535  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 
455 aa  169  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 
448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 
433 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  31.04 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 
469 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.07 
 
 
485 aa  143  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  33.03 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 
571 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  28.94 
 
 
582 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  27.8 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 
471 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  29 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 
456 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 
430 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 
494 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
480 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 
561 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
480 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.88 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  30.75 
 
 
422 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 
581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 
477 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 
472 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 
582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 
620 aa  111  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 
386 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  27.97 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 
572 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.03 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 
455 aa  110  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 
396 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 
433 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 
502 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 
484 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 
457 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 
226 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  33.67 
 
 
311 aa  103  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.71 
 
 
634 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 
473 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  26.37 
 
 
663 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 
472 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  33.5 
 
 
453 aa  100  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
412 aa  97.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 
469 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  30.62 
 
 
526 aa  96.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  30.62 
 
 
522 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.38 
 
 
382 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.64 
 
 
462 aa  94.7  3e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 
545 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.27 
 
 
687 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 
413 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  30 
 
 
508 aa  93.6  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 
492 aa  93.2  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 
481 aa  93.2  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 
611 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 
385 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 
478 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  90.5  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 
394 aa  90.1  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
391 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  26.08 
 
 
470 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 
519 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27 
 
 
467 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 
189 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 
538 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  25.75 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  30.33 
 
 
1492 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  26.12 
 
 
555 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 
454 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 
628 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.38 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 
586 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 
1123 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  22.2 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  23.01 
 
 
383 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  27.83 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  25.81 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 
564 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  23.87 
 
 
484 aa  73.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>