60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1249 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  97.87 
 
 		 455 aa  283  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  58.73 
 
 		 433 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  52 
 
 		 448 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 448 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  39.84 
 
 		 456 aa  102  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 500 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 		 468 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 459 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 		 479 aa  84.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0666  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0430464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 634 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3995  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 658 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480395  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.5 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 571 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 641 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 469 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 619 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 477 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 463 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 469 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 		 561 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 455 aa  51.6  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 383 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 478 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  29.79 
 
 		 462 aa  48.5  0.00005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3965  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.101474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 371 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 		 502 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 446 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0697  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 852 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  42.22 
 
 		 481 aa  45.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  25.34 
 
 		 687 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.33 
 
 		 373 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 582 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.31 
 
 		 374 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.31 
 
 		 374 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.31 
 
 		 374 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 485 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 522 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  40.38 
 
 		 526 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 375 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  34.57 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 502 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.77 
 
 		 620 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.21 
 
 		 373 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  34.38 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2039  Sigma 54 interacting domain protein  40.98 
 
 		 840 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  34.72 
 
 		 367 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.51 
 
 		 368 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2709  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  35.38 
 
 		 398 aa  41.6  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0391766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 408 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.81 
 
 		 370 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 471 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.21 
 
 		 379 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 484 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>