124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0101 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  100 
 
 
663 aa  1353    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  41.19 
 
 
509 aa  296  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  37.53 
 
 
519 aa  260  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 
494 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 
394 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 
471 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 
376 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 
459 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 
455 aa  96.3  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  26.73 
 
 
634 aa  95.1  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 
394 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 
582 aa  94  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.59 
 
 
485 aa  93.2  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 
480 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 
468 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 
402 aa  90.1  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 
479 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  29.54 
 
 
480 aa  88.2  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 
403 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  23.82 
 
 
403 aa  86.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 
606 aa  84.7  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
481 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 
456 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.43 
 
 
687 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  23.57 
 
 
483 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.23 
 
 
561 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 
571 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 
462 aa  79  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  39.32 
 
 
276 aa  76.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 
628 aa  73.9  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 
641 aa  73.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 
619 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.19 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 
492 aa  69.7  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  24.01 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.13 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 
572 aa  67.8  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  29.73 
 
 
1492 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 
389 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 
620 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 
413 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
374 aa  65.1  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 
502 aa  65.1  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  27.32 
 
 
453 aa  63.9  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 
412 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 
423 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 
467 aa  63.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  24.54 
 
 
478 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 
488 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  22.65 
 
 
423 aa  62  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.46 
 
 
430 aa  61.6  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.57 
 
 
311 aa  61.2  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 
454 aa  60.8  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.78 
 
 
463 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 
469 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 
457 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  20.87 
 
 
483 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 
383 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  23.31 
 
 
382 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 
462 aa  58.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 
508 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.82 
 
 
412 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 
500 aa  58.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 
472 aa  57.4  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  26.59 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  23.86 
 
 
479 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  31.62 
 
 
423 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  22.16 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.08 
 
 
475 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
207 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 
478 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 
545 aa  54.7  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 
391 aa  53.9  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  23.04 
 
 
402 aa  53.9  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  36 
 
 
582 aa  53.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  25.21 
 
 
422 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 
589 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 
483 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  28.93 
 
 
442 aa  52  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 
226 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  22.89 
 
 
1123 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  24.18 
 
 
522 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  24.18 
 
 
526 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 
538 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4318  hypothetical protein  22.28 
 
 
376 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598317  normal  0.713921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>