148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1459 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 571 aa  1167    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  37.43 
 
 		 582 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  34.93 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  32.72 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 687 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 606 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 634 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 611 aa  163  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 619 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 		 602 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 478 aa  153  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  30.52 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 641 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  26.97 
 
 		 628 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 448 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  25.1 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 485 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 433 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  29.54 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.95 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  26.73 
 
 		 475 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 622 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 386 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 403 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  28.06 
 
 		 403 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 620 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 500 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 413 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  27.25 
 
 		 423 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  24.95 
 
 		 543 aa  100  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 455 aa  100  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 545 aa  97.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 423 aa  96.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 		 457 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 402 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  28.19 
 
 		 479 aa  94  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 385 aa  93.2  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 		 471 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.64 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 663 aa  92.8  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3965  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 213 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.101474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  24.02 
 
 		 374 aa  90.9  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.84 
 
 		 382 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 508 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 402 aa  87.4  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 504 aa  87.4  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 480 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  31.33 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  23.8 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  22.57 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  22.63 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  22.57 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 582 aa  80.5  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  22.91 
 
 		 643 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.18 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  28.4 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  23.93 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.02 
 
 		 226 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  24 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 446 aa  72  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  33.1 
 
 		 483 aa  72  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  32.26 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>