163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0558 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  73.33 
 
 		 555 aa  828    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 556 aa  1117    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  44.18 
 
 		 551 aa  422  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  37.59 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  34.72 
 
 		 548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  30.96 
 
 		 582 aa  214  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 538 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 448 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  41.78 
 
 		 206 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 568 aa  107  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  24.42 
 
 		 564 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  24.76 
 
 		 622 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 448 aa  99.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 455 aa  99.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.05 
 
 		 433 aa  97.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.45 
 
 		 687 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 469 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 620 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 545 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.43 
 
 		 446 aa  90.5  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 433 aa  90.1  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 		 581 aa  90.1  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 396 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 430 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 499 aa  89.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 455 aa  87  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  23.84 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  22.89 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  25.16 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.48 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 572 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.93 
 
 		 403 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.93 
 
 		 403 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  23.43 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.64 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.09 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  23.63 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  41.67 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2241  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  23.39 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 606 aa  77.4  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  34.05 
 
 		 571 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  22.98 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  26.34 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.48 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  28.27 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 620 aa  73.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 620 aa  73.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  29.68 
 
 		 276 aa  73.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  24.23 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 599 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 412 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 		 611 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 472 aa  72  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 		 457 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  34.17 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.21 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  20.65 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 488 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  23.6 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  25.87 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  24.09 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 		 467 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 634 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3966  hypothetical protein  35.59 
 
 		 105 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0463962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  27.9 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.31 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  26.04 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>