150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0230 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 456 aa  908    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  61.03 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  60.31 
 
 		 459 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  59.74 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 433 aa  170  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  32.33 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 582 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  30.52 
 
 		 571 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  29.16 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  28.05 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23.86 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  26.41 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 471 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  33.04 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 423 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 641 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 500 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 634 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 572 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  29.47 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 545 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 		 581 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 226 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25.56 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 687 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  28.25 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  28.25 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 606 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  28.61 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 508 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23.04 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 502 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 628 aa  93.2  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  34.22 
 
 		 394 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  27.53 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  27.53 
 
 		 526 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  30 
 
 		 311 aa  89.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 611 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1492 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  26.04 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  24.68 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 374 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 		 383 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  29.16 
 
 		 538 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  25.2 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 586 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 663 aa  83.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 556 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  25.69 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  28.98 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1249  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.629566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.45 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 560 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  21.9 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>