112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0664 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  98.33 
 
 		 385 aa  597  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  41.38 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  39.45 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 402 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 454 aa  203  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 396 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 485 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 		 522 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  31.96 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 508 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 500 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 480 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 403 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  27.82 
 
 		 403 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 502 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 455 aa  97.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 455 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 412 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 448 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 448 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 471 aa  90.5  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 479 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 494 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 468 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 		 423 aa  86.7  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 457 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 422 aa  85.9  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  27.16 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 481 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.34 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 509 aa  76.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 456 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  44.34 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.26 
 
 		 376 aa  75.5  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.07 
 
 		 582 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 628 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 433 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1492 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  24.01 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  24.03 
 
 		 492 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 394 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  24.19 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.42 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.09 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  30.41 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  32.76 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  28.31 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  33.63 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  23.83 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  24.5 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.58 
 
 		 606 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  25.26 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  24.84 
 
 		 484 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 561 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.66 
 
 		 687 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  23.36 
 
 		 619 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 582 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 611 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 469 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 		 538 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 656 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  22.94 
 
 		 478 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1275  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 545 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 656 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>