18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2123 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2123  putative transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  320  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 
457 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 
446 aa  67.8  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 
383 aa  67.8  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  27.56 
 
 
475 aa  58.9  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  26 
 
 
276 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  26.53 
 
 
442 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 
515 aa  52  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  26.67 
 
 
462 aa  50.8  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  23.18 
 
 
311 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  27.91 
 
 
328 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25.18 
 
 
462 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 
455 aa  44.3  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 
504 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
453 aa  41.2  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 
480 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  36.36 
 
 
331 aa  40.4  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  45 
 
 
479 aa  40.4  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>