292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1856 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  49.09 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  57.33 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  53.73 
 
 		 342 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  48.8 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.7 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.89 
 
 		 336 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.96 
 
 		 316 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.58 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  53.94 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  42.64 
 
 		 352 aa  275  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  55.81 
 
 		 224 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  27.94 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.2 
 
 		 358 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.28 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.03 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  29.15 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  26.07 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.5 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  26.07 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.16 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.71 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  26.63 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.37 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  54.79 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.21 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.92 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  25.5 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.3 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.48 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.09 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  28 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  25.22 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  32.09 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.09 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.43 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.87 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.53 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.39 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.8 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  41.94 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.7 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.03 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  46.75 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.6 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.89 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  28.51 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.42 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.12 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.25 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  28.64 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.29 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.45 
 
 		 443 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2116  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.24 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.82 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.22 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.8 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.67 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  27.97 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  26.32 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.95 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.59 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  26.35 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.18 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.28 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  31.88 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.72 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.2 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  29.96 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.78 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  27.71 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.96 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  39.5 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.8 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.44 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.25 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.7 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  28.89 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.95 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.8 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.39 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  34.78 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.03 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.87 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.62 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.12 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  23 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.35 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.59 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.95 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.76 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>