297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0937 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 368 aa  758    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  68.48 
 
 		 367 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  35.18 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  30.81 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  30.81 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  26.76 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.65 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.69 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.69 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  28.02 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  25.14 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.38 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.18 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  25 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.78 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  26.81 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.41 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  25.24 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.25 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.98 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  27.34 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.55 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.22 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  24.25 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.71 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.02 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.04 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  22.11 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.79 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.22 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.53 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  27.64 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.02 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  26.33 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  25.7 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.82 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  25.56 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.71 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.82 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.82 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.81 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.38 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.1 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.37 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.87 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  26.1 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.52 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  25.15 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.93 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  25.15 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.96 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  25.43 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  25.15 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.39 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  28.24 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.08 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  26.39 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  25.67 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2034  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  26.13 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.86 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  25.52 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  27.21 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3993  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.17 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.284344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.66 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.4 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.73 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.3 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.16 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.1 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.89 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0834  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.04 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.12 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.1 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.35 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.01 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.82 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  27.96 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.06 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  24.56 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  26.73 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.88 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  23.84 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.74 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  25.21 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.63 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  24.82 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.48 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.41 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  28.91 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>