297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0300 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  84.79 
 
 		 393 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 398 aa  800    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  80.51 
 
 		 393 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  83.67 
 
 		 393 aa  661    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.34 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.77 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.67 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.83 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.76 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  54.26 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.84 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.93 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  54.88 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  55.05 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  54.49 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.69 
 
 		 391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.73 
 
 		 401 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.08 
 
 		 398 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.58 
 
 		 384 aa  308  8e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.41 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  47.49 
 
 		 383 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.41 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.02 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  43.02 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.56 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.22 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  37.36 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.13 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.21 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  36.99 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.21 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.87 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.06 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.58 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.68 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.53 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.92 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.8 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  32.08 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.04 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.31 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.46 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.83 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.1 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  31.07 
 
 		 373 aa  166  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.23 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.03 
 
 		 385 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.66 
 
 		 363 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.84 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.36 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.53 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.29 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  28.11 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  29.26 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  37.55 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  32.69 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  37.55 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  27.75 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.28 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.51 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.56 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  29.38 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.43 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.68 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  31.98 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 392 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.32 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.25 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.14 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.77 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.03 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  31.22 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.27 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.88 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  32.27 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  31.01 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.86 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  33.62 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.35 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  30.06 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.03 
 
 		 419 aa  90.5  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.89 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.92 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.21 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.71 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  25.29 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.94 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.6 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.43 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6171  hypothetical protein  27.7 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000902678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.15 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.81 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.23 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>