269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0373 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 371 aa  751    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  56.79 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.1 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.75 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.94 
 
 		 369 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.97 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  40.28 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.18 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.37 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.39 
 
 		 384 aa  229  7e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  38.57 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  37.04 
 
 		 377 aa  226  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.68 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.6 
 
 		 380 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.28 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.2 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  39.2 
 
 		 358 aa  206  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.52 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.63 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.9 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  39.88 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.66 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.63 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  38.89 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  36.13 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.53 
 
 		 386 aa  192  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.69 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.08 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.9 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.44 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.6 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.32 
 
 		 392 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.03 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  36.96 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.07 
 
 		 390 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.15 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.38 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  38 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.03 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.21 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  31 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.7 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.27 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.23 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  30.39 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.25 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.38 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.2 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.61 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.32 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  29.25 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.09 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.86 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  29.67 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  29.59 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.45 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  28.82 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  31.09 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.82 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.43 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  30.41 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  33.65 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  32.95 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.57 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.73 
 
 		 373 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.71 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.13 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.65 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.22 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.63 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  35.22 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.72 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.01 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  30.71 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.33 
 
 		 412 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  31.79 
 
 		 200 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.27 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.8 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.83 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.76 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.73 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.98 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.36 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  26.76 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  25.78 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.25 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.53 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.79 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.1 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  26.61 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  27.23 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  26.61 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.86 
 
 		 236 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.23 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.47 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6171  hypothetical protein  32.43 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000902678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>