299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3305 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  90 
 
 		 393 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  83.67 
 
 		 398 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  84.87 
 
 		 393 aa  670    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 393 aa  798    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.78 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.81 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.69 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.46 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.58 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.12 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  57.78 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.4 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  55.75 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  54.86 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  55.05 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.8 
 
 		 391 aa  356  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.96 
 
 		 401 aa  348  9e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.34 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.24 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  46.61 
 
 		 383 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.44 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.44 
 
 		 380 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.94 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  42.17 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.74 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  36.81 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.43 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.93 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.67 
 
 		 374 aa  216  4e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.04 
 
 		 369 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  35.36 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.83 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.94 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.49 
 
 		 401 aa  203  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.51 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.28 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.2 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.16 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  33.04 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.11 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.86 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.7 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.34 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.38 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.75 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  31.51 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.13 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.27 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.91 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.18 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.46 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.25 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.04 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.07 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.85 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.59 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.7 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  32.04 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  28.01 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  31.67 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  29.4 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  28.9 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  27.99 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  37.45 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.49 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.81 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  37.45 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.24 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.94 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.14 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  31.81 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.62 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  35.2 
 
 		 200 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.53 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  34.05 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.74 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.93 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.62 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  30.67 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  30.62 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 427 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  29.39 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.56 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.58 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.48 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.43 
 
 		 419 aa  89.4  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.91 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.65 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6171  hypothetical protein  25.83 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000902678  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.82 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.22 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.94 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.64 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>