173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0297 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  89.77 
 
 		 363 aa  332  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  75.42 
 
 		 375 aa  295  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  68.16 
 
 		 372 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.28 
 
 		 358 aa  238  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  56.42 
 
 		 371 aa  224  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  56.42 
 
 		 342 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.82 
 
 		 359 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  49.71 
 
 		 373 aa  176  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.12 
 
 		 358 aa  176  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.82 
 
 		 359 aa  168  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.61 
 
 		 357 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  45.61 
 
 		 356 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  45.03 
 
 		 359 aa  160  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.71 
 
 		 374 aa  157  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  49.71 
 
 		 356 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.59 
 
 		 360 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.51 
 
 		 356 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.27 
 
 		 377 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.95 
 
 		 361 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.71 
 
 		 373 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.2 
 
 		 393 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.03 
 
 		 393 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.56 
 
 		 393 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 384 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.71 
 
 		 387 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.76 
 
 		 384 aa  104  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  32.95 
 
 		 386 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.7 
 
 		 386 aa  99.4  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.08 
 
 		 385 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.4 
 
 		 394 aa  97.8  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 398 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  33.72 
 
 		 383 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 384 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.85 
 
 		 377 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  29.94 
 
 		 358 aa  95.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.9 
 
 		 369 aa  95.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  30.59 
 
 		 368 aa  94.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.94 
 
 		 387 aa  94.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  34.27 
 
 		 377 aa  94.7  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.78 
 
 		 391 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  33.53 
 
 		 388 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.9 
 
 		 387 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  33.14 
 
 		 377 aa  92.4  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  29.17 
 
 		 373 aa  92  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.79 
 
 		 371 aa  92  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 384 aa  90.1  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 395 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.79 
 
 		 392 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.28 
 
 		 401 aa  89  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.53 
 
 		 398 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 380 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.38 
 
 		 381 aa  85.1  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2305  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.29 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.73 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.69 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.22 
 
 		 394 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.85 
 
 		 398 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  33.33 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  32 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.89 
 
 		 381 aa  78.6  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.77 
 
 		 390 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.43 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.85 
 
 		 392 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.19 
 
 		 380 aa  74.7  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.26 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.33 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.93 
 
 		 349 aa  68.2  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.61 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.67 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.44 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.49 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  30 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.19 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 376 aa  58.9  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.74 
 
 		 427 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  44.93 
 
 		 416 aa  58.5  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  33.33 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  32.41 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.04 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  34.94 
 
 		 360 aa  55.1  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.74 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.74 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  26.45 
 
 		 394 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.73 
 
 		 402 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.19 
 
 		 421 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  32.73 
 
 		 342 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.03 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.53 
 
 		 393 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  28.85 
 
 		 328 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.99 
 
 		 394 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.52 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.94 
 
 		 336 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  25.16 
 
 		 406 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>