260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6610 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 374 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  92.51 
 
 		 386 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  99.2 
 
 		 374 aa  746    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  90.88 
 
 		 373 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  99.2 
 
 		 374 aa  746    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  76.96 
 
 		 384 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  76.69 
 
 		 374 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.9 
 
 		 372 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  72.16 
 
 		 371 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  66.12 
 
 		 371 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  66.94 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  62.81 
 
 		 365 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  60.33 
 
 		 371 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.09 
 
 		 368 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.5 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  59.23 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  53.87 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  49.59 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  54.35 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.53 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.14 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.7 
 
 		 374 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  47.14 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  46.87 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.52 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  45.45 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.86 
 
 		 309 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.51 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  45.45 
 
 		 373 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.41 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.66 
 
 		 371 aa  299  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.66 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.39 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.66 
 
 		 371 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  44.53 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.66 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.05 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.69 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  42.39 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.39 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.67 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.84 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.16 
 
 		 375 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  43.05 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.16 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.62 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  38.71 
 
 		 389 aa  272  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  38.34 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.34 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.05 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.68 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.3 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  40.27 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.67 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.95 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.5 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.5 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.06 
 
 		 371 aa  222  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.71 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.85 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  35.39 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.43 
 
 		 373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  31.48 
 
 		 369 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.61 
 
 		 151 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  42.25 
 
 		 156 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.8 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25.65 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25.36 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.27 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  28.57 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.82 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.48 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.54 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.21 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  29.8 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  29.13 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.05 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  28.21 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.72 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  39.45 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  34.78 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  27.14 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.61 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.88 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.45 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  25.82 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.85 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.25 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  21.73 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  25.35 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  30.77 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.38 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  30.63 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  31.65 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.78 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.86 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.75 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  38.6 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.21 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>