273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0523 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  100 
 
 		 376 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  83.06 
 
 		 376 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  71.24 
 
 		 379 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  71.16 
 
 		 373 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  69.54 
 
 		 373 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  68.62 
 
 		 381 aa  521  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  70.48 
 
 		 386 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  56.8 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  56.27 
 
 		 376 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.27 
 
 		 376 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.72 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.83 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.95 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.21 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.49 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.49 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.76 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  50.95 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.68 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.22 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.33 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  43.4 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  43.13 
 
 		 378 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.73 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  43.82 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  42.67 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.35 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  41.08 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.4 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.3 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  39.73 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.05 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.05 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.05 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.28 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.13 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.95 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  43.43 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.59 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.67 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  41.13 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.94 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.22 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  42.94 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.98 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  39.95 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.11 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.4 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.24 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.24 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.38 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.19 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.83 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.03 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  37.3 
 
 		 368 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.92 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  37.7 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.92 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.49 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.87 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  33.87 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.65 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.39 
 
 		 313 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.7 
 
 		 151 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  41.1 
 
 		 156 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.13 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  26.98 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  26.98 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  27.49 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  30.41 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.85 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.52 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 349 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.92 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  27.86 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.8 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.5 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.29 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.72 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.17 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  38.14 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.02 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.34 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.67 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.41 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  22.85 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  22.9 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  31.93 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.71 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.75 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.3 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.91 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.97 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.34 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.38 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  27.93 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>