274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4924 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 369 aa  756    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  81.57 
 
 		 365 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  73.02 
 
 		 368 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.65 
 
 		 371 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  71.35 
 
 		 375 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.39 
 
 		 371 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.39 
 
 		 371 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  72.19 
 
 		 371 aa  544  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.31 
 
 		 371 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  71.39 
 
 		 371 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  70.63 
 
 		 375 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.22 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  55.95 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  56.22 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.99 
 
 		 381 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  54.81 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.16 
 
 		 379 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  54.28 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  54.72 
 
 		 376 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.83 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  52.56 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  43.13 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.9 
 
 		 371 aa  298  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  43.7 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  42.2 
 
 		 378 aa  295  9e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.16 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.78 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  42.2 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  42.7 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.89 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  42.59 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  41.24 
 
 		 376 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.67 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.55 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.55 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.24 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.62 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  42.16 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.94 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.64 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.54 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  41.34 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.46 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  41.8 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.52 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.16 
 
 		 376 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.38 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.22 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.9 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  69.93 
 
 		 151 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.98 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  36.9 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.83 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.84 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.84 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.46 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.22 
 
 		 367 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  35.48 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.98 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.2 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  34.32 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.17 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.35 
 
 		 343 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.66 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  34.42 
 
 		 156 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.48 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25.23 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25.23 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.83 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.73 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.62 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.55 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.43 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.07 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  30.16 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.44 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  27.31 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  29.5 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.83 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  26.39 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  29.91 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.91 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2548  hypothetical protein  25.09 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  28.5 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.21 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.99 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.78 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  25 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  34.71 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  36.89 
 
 		 195 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.32 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  27.18 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>