259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0723 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 373 aa  769    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  75.87 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  70.69 
 
 		 318 aa  485  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  56.4 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.51 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  53.8 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.53 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  53.8 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  53.78 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.41 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.41 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  51.5 
 
 		 367 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.83 
 
 		 374 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.22 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  52.04 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.17 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.64 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.41 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.41 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.36 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  51.36 
 
 		 386 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.16 
 
 		 374 aa  325  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.55 
 
 		 374 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.09 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  44.3 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.56 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  44.44 
 
 		 373 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  44.18 
 
 		 373 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  43.05 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  42.51 
 
 		 378 aa  285  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.63 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.77 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.85 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.12 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.42 
 
 		 371 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.24 
 
 		 375 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.85 
 
 		 371 aa  275  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  42.12 
 
 		 371 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.12 
 
 		 371 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.42 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.26 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  41.11 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.78 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.59 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.38 
 
 		 369 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  37.77 
 
 		 376 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  38.13 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.77 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.73 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.21 
 
 		 408 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.78 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.34 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.79 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.79 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.62 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  35.48 
 
 		 364 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.96 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  33.15 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.76 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 373 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.89 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 371 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  30.28 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.09 
 
 		 313 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.38 
 
 		 151 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  38.52 
 
 		 156 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  27.32 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  27.32 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.7 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.39 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.88 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.01 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.93 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.7 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.85 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  24.62 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.24 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.31 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  23.62 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  28.27 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.62 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  25.66 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.74 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  25.74 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.45 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.16 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.01 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  23.3 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.73 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.16 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  27.32 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.73 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.69 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.43 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>