272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4817 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 379 aa  767    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  88.14 
 
 		 373 aa  670    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  86.79 
 
 		 373 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.46 
 
 		 376 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.85 
 
 		 381 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  74.21 
 
 		 386 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  71.24 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.44 
 
 		 376 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  55.7 
 
 		 389 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  55.17 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.16 
 
 		 369 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.69 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.93 
 
 		 365 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.56 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.1 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.8 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.83 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.1 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.02 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  52.29 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.67 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  45.95 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  45.68 
 
 		 378 aa  333  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  47.06 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.11 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.01 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.75 
 
 		 374 aa  308  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  45.01 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.85 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  43.13 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.85 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.73 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  44.2 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.91 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.41 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.28 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.28 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.44 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  44.74 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  40.59 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.99 
 
 		 372 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  43.48 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.59 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  46.63 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.56 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.59 
 
 		 373 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.23 
 
 		 376 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.72 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.41 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.41 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.4 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.44 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.3 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.82 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  38.04 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.97 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.6 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  36.93 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.69 
 
 		 318 aa  226  7e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.9 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.12 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  35.85 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.73 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.71 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.33 
 
 		 151 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  43.42 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  41.6 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.92 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.48 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.52 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.75 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.07 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  27 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  21.91 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.98 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.7 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0095  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.8 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  25.23 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.77 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  27.31 
 
 		 314 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.75 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.92 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.06 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.13 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.88 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.06 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  27.59 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  28.27 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.47 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  26.4 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.26 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>