271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2002 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 375 aa  781    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  71.73 
 
 		 376 aa  580  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  44.5 
 
 		 378 aa  322  7e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  43.97 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.32 
 
 		 381 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  41.64 
 
 		 373 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  41.38 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.91 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  38.89 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.11 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  41.82 
 
 		 384 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.21 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  39.27 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.01 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.1 
 
 		 368 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  43.56 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.3 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.69 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  40.96 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.4 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.62 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.62 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.62 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.39 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.83 
 
 		 371 aa  272  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  38.4 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.52 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.2 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.99 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  38.34 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  36.94 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.4 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.93 
 
 		 371 aa  269  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  39.55 
 
 		 386 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.3 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.93 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.2 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  39.74 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  39.73 
 
 		 367 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.4 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.01 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.1 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  37.67 
 
 		 371 aa  262  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.26 
 
 		 373 aa  262  8.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.73 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  40.27 
 
 		 367 aa  255  7e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.17 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.47 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.82 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  36.83 
 
 		 364 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  35.86 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.01 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.16 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.97 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.97 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.92 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.31 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.57 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.79 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.97 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.42 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  33.6 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.41 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  37.67 
 
 		 156 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.01 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  35.29 
 
 		 195 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.55 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  27.27 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  30.16 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  34.33 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  27.4 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  35.59 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.32 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  29.52 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  26.28 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.06 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  32.82 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.38 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.78 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  26.24 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  30.26 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.73 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.58 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  28.49 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.43 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  24.85 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.85 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.48 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.52 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  26.43 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  28.82 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  22.95 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.85 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>