271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2616 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 368 aa  747    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  70.11 
 
 		 376 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  70.57 
 
 		 370 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  67.95 
 
 		 371 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  69.86 
 
 		 365 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  65.11 
 
 		 373 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  64.31 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  57.85 
 
 		 367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  60.16 
 
 		 367 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  63.09 
 
 		 384 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  62.09 
 
 		 371 aa  454  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.09 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.09 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.09 
 
 		 374 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.33 
 
 		 372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.47 
 
 		 371 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.81 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  62.91 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  54.86 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.51 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.95 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.11 
 
 		 374 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  46.72 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  46.45 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.14 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  47.17 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  46.9 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.52 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.32 
 
 		 309 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.01 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  46.81 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.92 
 
 		 376 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.4 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.19 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.86 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  41.46 
 
 		 371 aa  288  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.65 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.1 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.96 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.92 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.24 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.14 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  41.33 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  41.07 
 
 		 376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.07 
 
 		 376 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.37 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.33 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  42.59 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.14 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.25 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.32 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.3 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  39.89 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.55 
 
 		 367 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.73 
 
 		 371 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.17 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  36.27 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.3 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.01 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.01 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  36.63 
 
 		 369 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.74 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.24 
 
 		 151 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  42.34 
 
 		 156 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.41 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  28.43 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.19 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  28.43 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  29.69 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.53 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.41 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.51 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  31.85 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.44 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  25.24 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  21.56 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.4 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.17 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3993  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.73 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.284344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  21.27 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.98 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.74 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2034  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.75 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.04 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.49 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.41 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.88 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.26 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  24.05 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.86 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.76 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.29 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.72 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.4 
 
 		 422 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.47 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.41 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>