274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  97.86 
 
 		 373 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  88.14 
 
 		 379 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  73.19 
 
 		 376 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  76.74 
 
 		 386 aa  564  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  75.34 
 
 		 381 aa  564  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  71.16 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.3 
 
 		 376 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  56.72 
 
 		 389 aa  424  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  56.03 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.13 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.86 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  54.28 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.93 
 
 		 371 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.66 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.93 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.93 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.62 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  53.39 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.85 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.47 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  45.53 
 
 		 378 aa  332  5e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  45.26 
 
 		 378 aa  332  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  47.3 
 
 		 384 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.9 
 
 		 368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.11 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.45 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.45 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.45 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.17 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.68 
 
 		 374 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.59 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.64 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.21 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  43.94 
 
 		 365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.41 
 
 		 371 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  42.16 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  46.26 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.68 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  44.39 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  43.13 
 
 		 376 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  43.75 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  40.05 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.8 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.78 
 
 		 370 aa  292  8e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.1 
 
 		 376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.18 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.38 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.72 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.86 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.86 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.65 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.46 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.4 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  38.63 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.53 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  36.9 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.48 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.86 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.86 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  36.04 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.28 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.39 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.76 
 
 		 151 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  42.47 
 
 		 156 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.23 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  23.85 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.94 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  24.64 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.1 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  24.64 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.29 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.15 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.23 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  39.13 
 
 		 195 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.15 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.51 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.79 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  25.6 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.47 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.98 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.99 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.59 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0095  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.32 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.23 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  25.86 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.94 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  24.53 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.92 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  20.72 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.35 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1900  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.5 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  23.95 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.38 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.26 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.92 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>