283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6451 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 378 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  45.77 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.35 
 
 		 282 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.03 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.85 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4791  hypothetical protein  44.62 
 
 		 135 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25.23 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25.23 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.19 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.96 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  30.61 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.62 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  24.53 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.7 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.25 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.76 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.17 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.05 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  29.13 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.85 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.59 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  31.37 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.18 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.54 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  31.63 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  28.26 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  30.21 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.48 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  24.14 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  27.15 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  25.18 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.59 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.28 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.06 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.06 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.53 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  29.91 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  27.92 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.1 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.24 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  25.35 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  29.09 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.66 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  24.57 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.7 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.22 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.02 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.84 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.15 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  25.87 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  29.38 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.56 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.13 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  27.63 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  26.24 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  25.58 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.7 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.92 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.22 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  22.42 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  25.11 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.99 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  25.79 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  26.09 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.38 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.04 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.970284  decreased coverage  0.0093527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.11 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.72 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  30.27 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.34 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.87 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.09 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  30.6 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  24.22 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  30.81 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1101  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.78 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.18 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  27.35 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  27.55 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.67 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.76 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.23 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2034  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.36 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.24 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.58 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.67 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  38.2 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  34.59 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.21 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.17 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>