296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3067 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 374 aa  768    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  95.41 
 
 		 309 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  71.31 
 
 		 374 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  50.54 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  50.54 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  51.5 
 
 		 365 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.81 
 
 		 373 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  48.11 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  48.92 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.14 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.95 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.41 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.41 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  50.14 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.37 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.91 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  49.32 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.29 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  49.86 
 
 		 386 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.32 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  47.41 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.3 
 
 		 370 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  45.7 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.09 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.16 
 
 		 373 aa  309  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  43.48 
 
 		 373 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.85 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  43.21 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  42.59 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.27 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  42.23 
 
 		 389 aa  296  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  41.85 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.85 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.12 
 
 		 376 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.01 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.13 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.4 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.13 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.24 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.35 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  41.13 
 
 		 371 aa  285  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.48 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.59 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.79 
 
 		 376 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  41.3 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.59 
 
 		 368 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.64 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.82 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.1 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.2 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  37.74 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.44 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.44 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.22 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  36.73 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.06 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.22 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.47 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.7 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.62 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  31.08 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.58 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.33 
 
 		 151 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  43.62 
 
 		 156 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  27.18 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  27.18 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  36.94 
 
 		 195 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.62 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.86 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.92 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0777  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.8 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.52 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.08 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  25.75 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.63 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.19 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.72 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.62 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  28.26 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.93 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.11 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.89 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.67 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.13 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.58 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.44 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  26.37 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.9 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  25.73 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.44 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.94 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.66 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  24.76 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.96 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>