262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3916 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  100 
 
 		 431 aa  895    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  99.3 
 
 		 431 aa  889    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.24 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.81 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0731  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.34 
 
 		 446 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.79 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.55 
 
 		 456 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.01 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2116  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.55 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.73 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0095  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.58 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1455  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.55 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184885  normal  0.0996953 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.54 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0055  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.39 
 
 		 434 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0125874  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  33.55 
 
 		 348 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  33.55 
 
 		 348 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  28.69 
 
 		 314 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.15 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  26.07 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  25.16 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  25.79 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.31 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.22 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4749  hypothetical protein  48.68 
 
 		 77 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.270029  normal  0.221613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.1 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.48 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.6 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.68 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.66 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.01 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3636  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.39 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.91 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  27.08 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.78 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.31 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  24.87 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.81 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.75 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  30.35 
 
 		 348 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  23.58 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  24.21 
 
 		 349 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.89 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  26.83 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.65 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.12 
 
 		 316 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.94 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.24 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1219  hypothetical protein  21.32 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.743421  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  22.77 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.99 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.99 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.82 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.68 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  24.14 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  26.48 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.56 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.47 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  22.87 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  25.83 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.44 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 359 aa  67  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.35 
 
 		 387 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2548  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  67  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.5 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  22.26 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.31 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.02 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.42 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  23.23 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  24.27 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.62 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  28.91 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.1 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.8 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.88 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  31.45 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2183  fic family protein  24.67 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723486  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  25.57 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.12 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0834  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.13 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.43 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  26.28 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3993  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.8 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.284344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.33 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  23.95 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  23.97 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.27 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  28.74 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.75 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  27.33 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.97 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  27.33 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.33 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  26.03 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.28 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>