254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1972 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 349 aa  710    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  78.74 
 
 		 351 aa  560  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  78.39 
 
 		 349 aa  551  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3513  filamentation induced by cAMP protein Fic  74.71 
 
 		 369 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  69.25 
 
 		 349 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.71 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0096  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.33 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  57.23 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1281  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.05 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  38.51 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3993  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.07 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.284344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  32.04 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  28.62 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3636  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.9 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25.71 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25.71 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2548  hypothetical protein  30.38 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2034  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.69 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0834  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.86 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.7 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  25.23 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.05 
 
 		 367 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  24.14 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  28.1 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  31.44 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.86 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.21 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.06 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1710  hypothetical protein  24.56 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  26.42 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  32.59 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.25 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  29 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.19 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.48 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.48 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.76 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.44 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.22 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  28.24 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  26.89 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.92 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  23.38 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  28.14 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.7 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.33 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.61 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.11 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  30.16 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.92 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.47 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.8 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  28.64 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.95 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.82 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  23 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.45 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.18 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.24 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  26 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.65 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  28 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  27.53 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  25.47 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2342  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.13 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0305415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  33.04 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  32.48 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.48 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.82 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.46 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.08 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.78 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  28.93 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  27.6 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.29 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.46 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.61 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.23 
 
 		 247 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  28.41 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.64 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.23 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.35 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.65 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.21 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  29.32 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>