243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1166 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  48.84 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.75 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.57 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.32 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.51 
 
 		 245 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.92 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.09 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.16 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.11 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.4 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  37.82 
 
 		 328 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  40.33 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  39.09 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.24 
 
 		 306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.88 
 
 		 317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.42 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.64 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.28 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.02 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.62 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  33.49 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  33.48 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.06 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  28.31 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  25.96 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2745  fic family protein  26.67 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.413938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  32.84 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 335 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  36.96 
 
 		 348 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  36.96 
 
 		 348 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.18 
 
 		 299 aa  85.9  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  32.8 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10760  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.553511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.06 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0340  hypothetical protein  29.84 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0522117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0755  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.02 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.973476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.87 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.11 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.21 
 
 		 502 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.45 
 
 		 508 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0774  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.27 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000913684  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.55 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.52 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1818  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.92 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0277  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.35 
 
 		 508 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000636262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0838  Fic family protein  26.47 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0586885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.2 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  30.69 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.61 
 
 		 316 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.31 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  33.91 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.26 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.53 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  30.69 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.69 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  26 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.64 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0838  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.75 
 
 		 505 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1819  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.67 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.27 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.74 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  27.78 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.19 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2627  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.79 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1097  hypothetical protein  26.05 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.149406  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.59 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.14 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  28.37 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3460  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.42 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.66 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0924  hypothetical protein  28.41 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.04 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1123  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.5 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0705826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3297  mobile mystery protein B  30.48 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0444  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.09 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.401408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.42 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.13 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.34 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.34 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  25.12 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  38.52 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.73 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0913  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.11 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.876617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  24.31 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.42 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.3 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.45 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.27 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.21 
 
 		 369 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1784  fic family protein  26.14 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0465792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.9 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.9 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3106  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.73 
 
 		 464 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>